Hệ thống cơ sở vật chất tại Viện Kỹ thuật Hóa học, Trường Đại học Bách Khoa Hà Nội được tổ chức thành các 13 Phòng thí nghiệm dưới sự điều hành của các Bộ môn chuyên ngành và 1 Phòng thí nghiệm đầu tư tập trung đảm bảo cho các hoạt động Đào tạo và Nghiên cứu khoa học trình độ cao lĩnh vực Hóa học và Kỹ thuật Hóa học.
- PTN Công nghệ lọc hóa dầu và Vật liệu xúc tác hấp phụ
- PTN Hóa Vô cơ-ĐC
- PTN Hóa Hữu cơ
- PTN Hóa lý
- PTN Hóa Phân tích
- PTN Công nghệ Điện hóa và Bảo vệ kim loại
- PTN Công nghệ Vật liệu Silicat
- PTN Công nghệ các chất Vô cơ
- PTN Công nghệ In và Truyền thông
- PTN Quá trình-Thiết bị công nghệ Hóa học
- PTN Máy và Công nghệ hóa chất-dầu khí
- PTN Công nghệ Hữu cơ-Hóa dầu
- PTN Công nghệ Xenluloza-Giấy
- PTN Công nghệ Hóa dược và Hóa chất bảo vệ thực vật